Ka/Ks比率计算器

Ka/Ks比率计算器可用于计算碱基替代率Ka和颠换率Ks,进而得到Ka/Ks比率,用于估计基因分化的程度。

输入参数

计算结果

计算公式

Ka/Ks = (2 * N * (Σs)) / (Σp * (Σd + Σs))

其中:
N - 碱基对的总数
Σs - 颠换的总数
Σp - 碱基替代的总数
Σd - 错误配对的总数

Ka/Ks比率计算器使用指南

了解如何使用Ka/Ks比率计算器及其工作原理

使用方法

  1. 在“序列1”和“序列2”输入框中分别输入两个DNA序列。
  2. 点击“计算”按钮进行计算。
  3. 计算结果将显示在“Ka/Ks比率”输入框中。

原理说明

Ka/Ks比率是用于估计基因分化的一个重要指标。其中Ka代表非同义替换率(碱基替代导致的氨基酸变化),Ks代表同义替换率(碱基替代未导致氨基酸变化)。Ka/Ks比率大于1表明正向选择,小于1表明purifying selection,等于1表明中性进化。