Ka/Ks比率计算器可用于计算碱基替代率Ka和颠换率Ks,进而得到Ka/Ks比率,用于估计基因分化的程度。
Ka/Ks = (2 * N * (Σs)) / (Σp * (Σd + Σs))
其中: N - 碱基对的总数 Σs - 颠换的总数 Σp - 碱基替代的总数 Σd - 错误配对的总数
了解如何使用Ka/Ks比率计算器及其工作原理
Ka/Ks比率是用于估计基因分化的一个重要指标。其中Ka代表非同义替换率(碱基替代导致的氨基酸变化),Ks代表同义替换率(碱基替代未导致氨基酸变化)。Ka/Ks比率大于1表明正向选择,小于1表明purifying selection,等于1表明中性进化。